Obszar Sobiborskiego Parku jest stosunkowo mało przekształcony przez człowieka. Dzięki temu możemy spotkać tu wiele rzadkich zbiorowisk. Sobiborski Park Krajobrazowy jest parkiem typowo leśnym. Dominują tu siedliska boru świeżego, olsy, bory wilgotne i bagienne. W drzewostanie największy udział stanowi sosna, sporo jest również brzozy i olszy. Niewielki jest udział dębu, osiki i świerku. We florze SoPK wyróżniono 55 gatunków rzadkich, z których 44 objęte jest ochroną.

Charakterystyczna formacją roślinną są torfowiska. Występują tutaj ich trzy rodzaje: niskie, przejściowe i wysokie. Na tych obszarach zgrupowana jest większość gatunków borealnych, do których należą: wierzby lapońska i borówkolistna, brzoza niska, rosiczka długolistna, gnidosz królewski, przygiełka biała, bagnica torfowa.
Do gatunków atlantyckich należą rosiczka pośrednia, jezierza giętka, dziurawiec rozesłany.
Bogata jest roślinność związana z jeziorami i torfiankami. Występują tu grzybienie północnegrążele żółte, osoka aleosowata.
Niewielką powierzchnię zajmują tu ciepłolubne murawy napiaskowe, na których spotkać można chronione goździki piaskowe i lepnicę litewską.